Penentuan antibodi kepada pecahan mikrosomal kelenjar tiroid digunakan untuk mendiagnosis tiroiditis autoimun dan hipotiroidisme, di mana tahap antibodi dalam darah meningkat. Antibodi kepada mikrosom tiroid membentuk kompleks imun pada permukaan sel, mengaktifkan limfosit pelengkap dan sitotoksik, yang membawa kepada pemusnahan sel dan pembentukan proses keradangan dalam kelenjar tiroid.