Gejala lupus erythematosus sistemik dicirikan oleh polimorfisme yang jelas, tetapi hampir 20% kanak-kanak mempunyai varian monoorgan permulaan penyakit. Perjalanan lupus erythematosus sistemik biasanya beralun, dengan tempoh eksaserbasi dan remisi yang silih berganti. Secara umum, lupus erythematosus sistemik pada kanak-kanak dicirikan oleh permulaan dan perjalanan penyakit yang lebih akut, generalisasi yang lebih awal dan lebih ganas, dan hasil yang kurang baik berbanding orang dewasa.